Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phox2aQ62066 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms