Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms