Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Lrrn1Q61809 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn1Q61809 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Lrrn1Q61809 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Lrrn1Q61809 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lrrn1Q61809 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lrrn1Q61809 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn1Q61809 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms