Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli3Q61602 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli3Q61602 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms