Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne1Q61457 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms