Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcolceQ61398 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PcolceQ61398 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PcolceQ61398 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms