Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcanQ61361 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcanQ61361 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BcanQ61361 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcanQ61361 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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