Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tfap2bQ61313 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tfap2bQ61313 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms