Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Scarb1Q61009 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Scarb1Q61009 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb1Q61009 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms