Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf8Q60846 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms