Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms