Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mkrn3Q60764 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms