Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csnk2a1Q60737 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms