Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms