Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms