Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd5Q5VCS6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms