Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms