Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc11Q5U458 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms