Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r195Q5SVD6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r195Q5SVD6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r195Q5SVD6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r195Q5SVD6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r195Q5SVD6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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