Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms