Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms