Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms