Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps54Q5SPW0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms