Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm11487Q5RIS0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms