Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav6-2Q5R1I4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav6-2Q5R1I4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms