Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms