Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms