Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkaa1Q5EG47 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms