Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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