Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chsy3Q5DTK1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms