Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp13Q5BKP2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms