Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spag9Q58A65 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spag9Q58A65 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spag9Q58A65 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spag9Q58A65 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spag9Q58A65 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spag9Q58A65 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spag9Q58A65 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spag9Q58A65 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Spag9Q58A65 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms