Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms