Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Adamts18Q4VC17 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Adamts18Q4VC17 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms