Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Herc2Q4U2R1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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