Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf38aQ4FK66 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms