Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk4Q3V129 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms