Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms