Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms