Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd42Q3V096 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd42Q3V096 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms