Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933416C03RikQ3V063 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4933416C03RikQ3V063 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms