Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms