Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E330034G19RikQ3UWX6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms