Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdc42bpaQ3UU96 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdc42bpaQ3UU96 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms