Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms