Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsponQ3UPR9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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