Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec31aQ3UPL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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