Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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