Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Washc4Q3UMB9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Washc4Q3UMB9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms