Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E330014E10RikQ3UL33 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330014E10RikQ3UL33 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms